你是沐浴陽光的木葉，而我是深埋地下的根。看到這句話的火影粉第一個聯想到的自然是團藏，如果說木葉忍者村明面上的諜報機構是暗部，那麼團藏的根組織就是比暗部更加見不得光的一個存在。三國志11火影MOD按照原作的設定，把根獨立在瞭木葉之外，這無疑給瞭團藏獨當一面的機會。
遊戲中安排給團藏的出生地點，雖然是原版三國志11極富挑戰性的新野，但是從火影的地緣關系來看，這個坐標並不差。漢水以西占據襄陽和江陵的木葉是自傢人，東邊熊之國星影的戰力不敢恭維，波之國更是一群不懂忍術的漁夫。隻要宛城的佐助不來找麻煩，團藏和他的根真能活得很安逸，下面就讓我們開始根的骨幹人物介紹。
志村團藏（統92、武96、智116、政120、魅91）
老陰謀傢瞭，拋開情感方面的因素來看，個人認為志村團藏真的比猿飛日斬更適合當火影。三代在管理方面的水準太差，如果能夠延續二代對宇智波傢族的方針，也就扯不出團藏搞得那麼多“壞事”，團藏為瞭日斬背瞭太多的鍋。遊戲為他配置瞭勇將、亢奮、威風、神算、毒舌、輔佐和築城特技，既有對他忍術實力的肯定，也有對其心計手腕的認可。無奈他最後被岸本以劇情殺的方式安排掉瞭，一代梟雄就此落幕還是挺令人惋惜的。
團藏的身上帶著兩個寫輪眼道具，這是他對宇智波的血債，在原作裡他的手臂上都遠遠不止兩個眼睛呢。三國志11火影MOD的寫輪眼能為持有者附加明鏡特技，以此免疫擾亂和偽報，還順帶豐富瞭舌戰模式的話術卡牌，隨便怎麼嘴遁都不至於詞窮。
山中風（統92、武76、智92、政93、魅83）
算得上一位優秀的情報收集型上忍，都能跟著團藏去參加五影大會，可見實力絕對是木葉中的精銳。無奈山中一族的忍術太單一，交手的人又是宇智波帶土，戰敗身死也隻能怪他的命不好瞭。遊戲配置給他的技能都是計略方面的，鬼謀、言毒、詭計和反計都是軟控領域的特長。
油女取根（統92、武92、智84、政93、魅85）
同為團藏的貼身護衛，油女取根在作戰方面的能力要強於山中風，不然也不會作為演示而用山中風的屍體復活並投入忍界大戰。油女取根和鳴人有一個共同點，那就是在沒有參加中忍考試的前提下直接晉升，因為他的那雙手實在太毒瞭。如果不出意外，團藏坐穩火影之後的繼任者最有可能就是油女取根，建國同志的“握手殺”在他面前真心弱爆瞭。可惜在動畫中同樣作為劇情殺的犧牲品，遊戲裡配置瞭掃蕩、猛者、突襲和繁殖，老玩傢都明白具備猛者特長的人物必須另眼相看。
佐井（統88、武80、智84、政93、魅86）
作為頂替佐助的人被納入瞭第七班，和佐助最大的共同點就是冰塊臉。從忍術的角度來看，佐井的輸出全靠畫，基本依賴召喚物對敵人發起打擊，總體的攻擊性並不算很強，所以遊戲的武力設定介於油女取根和山中風之間。虛實、輔佐、遁走和血路四個技能，是對他在原作表現最貼合的搭配，佐井作為副將出戰還是不錯的，獨當一面就算瞭吧。除瞭以上四人尚可一戰，根組織還有信和寺井兩個白板龍套，相較五大國的戰力是不在同一個量級的。在三國志11火影MOD裡，團藏領銜的根組織向西打不過佐助和絕，不過往東擴張倒是綽綽有餘，厚積薄發或可與水影一戰。